"Katei Kyoushi x Saimin 2 The Animation" sigue la historia de Masato, un joven que sufre el abuso físico y mental de las hermanas Shinjo, dos mujeres mayores que trabajan como sus tutoras privadas. Agotado y desesperado, Masato recibe la ayuda de Sakiko, la dueña de un misterioso club llamado ‘Gentil Donna’. Sakiko le entrega un dispositivo de control mental que Masato utiliza para vengarse de sus maestras. Primero somete a Serina, abusando de ella sexualmente hasta dejarla completamente humillada y exhausta. Luego, manipula a Serina para que atrape a su siguiente víctima: su hermana Haruna. Así comienza una historia de venganza y dominación.